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网上有好多修改ulimit的文章，但大多仅限于对当前交互shell的修改，如果只是为了提高某一次执行脚本的文件句柄打开数，以下方法非常有效：
操作系统： CentOS 5.1 x86_64
1）修改当前交互终端的limit值
查询当前终端的文件句柄数： ulimit -n 回车，一般的系统默认的1024.
修改文件句柄数为65535，ulimit -n 65535.此时系统的文件句柄数为65535.
2）将ulimit 值添加到/etc/profile文件中（适用于有root权限登录的系统）
为了每次系统重新启动时，都可以获取更大的ulimit值，将ulimit 加入到/etc/profile 文件底部。
echo ulimit -n 65535 >>/etc/profile
source /etc/profile #加载修改后的profile
ulimit -n #显示65535，修改完毕！
OK，好多朋友都以为大功告成了，可以突然发现自己再次登录进来的时候，ulimit的值还是1024，这是为什么呢？
关键的原因是你登录的用户是什么身份，是不是root用户，由于服务器的root用户权限很大，一般是不能用来登录的，都是通过自己本人的登录权限进行登录，并通过sudo方式切换到root用户下进行工作。 用户登录的时候执行sh脚本的顺序：
/etc/profile.d/file
/etc/profile
/etc/bashrc
/mingjie/.bashrc
/mingjie/.bash_profile
由于ulimit -n的脚本命令加载在第二部分，用户登录时由于权限原因在第二步还不能完成ulimit的修改，所以ulimit的值还是系统默认的1024。
解决办法：
修改linux的软硬件限制文件/etc/security/limits.conf.
在文件尾部添加如下代码：
* soft nofile 65535
* hard nofile 65535
保存并推出，命令说明：
domino type item value
domino是以符号@开头的用户名或组名，*表示所有用户，type设置为hard or soft。item指定想限制的资源。如cpu,core nofile nproc or maxlogins。value是相应的限制值。
保存后如何让其文件生效呢，我在网上也搜索的很久，都没什么答案，最后很好笑的是，只需要重新登录一次，ulimit的值就生效了，如果还不行就 reboot（重新启动服务器）。
回答一、
[root@lxadmin nginx]# cat /proc/sys/fs/file-max
8192
文件系统最大可打开文件数
[root@lxadmin nginx]# ulimit -n
1024
程序限制只能打开1024个文件
使用[root@lxadmin nginx]# ulimit -n 8192调整一下
或者永久调整打开文件数 可在启动文件/etc/rc.d/rc.local末尾添加（在/etc/sysctl.conf末尾添加fs.file-max=xxx无效）
ulimit -n 8192
回答二、
Linux内核有时会报告“Too many open files”，起因是file-max默认值（8096）太小。要解决这个问题，可以root身份执行下列命令（或将它们加入/etc/rcS.d/*下的init脚本。）
# echo "65536" > /proc/sys/fs/file-max # 适用于2.2和2.4版内核
# echo "131072" > /proc/sys/fs/inode-max # 仅适用于2.2版内核
回答三、
办法是修改操作系统的打开文件数量限制，方法如下：
1. 按照最大打开文件数量的需求设置系统， 并且通过检查/proc/sys/fs/file-max文件来确认最大打开文件数已经被正确设置。
# cat /proc/sys/fs/file-max
如果设置值太小， 修改文件/etc/sysctl.conf的变量到合适的值。 这样会在每次重启之后生效。 如果设置值够大，跳过下步。
# echo 2048 > /proc/sys/fs/file-max
编辑文件/etc/sysctl.conf，插入下行。
fs.file-max = 8192
2. 在/etc/security/limits.conf文件中设置最大打开文件数， 下面是一行提示：
#
添加如下这行。
* - nofile 8192
这行设置了每个用户的默认打开文件数为2048。 注意"nofile"项有两个可能的限制措施。就是项下的hard和soft。 要使修改过得最大打开文件数生效，必须对这两种限制进行设定。 如果使用"-"字符设定, 则hard和soft设定会同时被设定。
硬限制表明soft限制中所能设定的最大值。 soft限制指的是当前系统生效的设置值。 hard限制值可以被普通用户降低。但是不能增加。 soft限制不能设置的比hard限制更高。 只有root用户才能够增加hard限制值。
当增加文件限制描述，可以简单的把当前值双倍。 例子如下， 如果你要提高默认值1024， 最好提高到2048， 如果还要继续增加， 就需要设置成4096。
另外一种情况是在创建索引的时候，也有两种可能，一种是合并因子太小，导致创建文件数量超过操作系统限制，这时可以修改合并因子，也可以修改操作系统的打开文件数限制；另外一种是合并因子受虚拟机内存的限制，无法调整到更大，而 需要索引的doc 数量又非常的大，这个时候就只能通过修改操作系统的打开文件数限制来解决了。
在此基础上，我还修改了以下一个配置文件
vi /etc/sysctl.conf
添加：
# Decrease the time default value for tcp_fin_timeout connection
net.ipv4.tcp_fin_timeout = 30
# Decrease the time default value for tcp_keepalive_time connection
net.ipv4.tcp_keepalive_time = 1800
# Turn off tcp_window_scaling
net.ipv4.tcp_window_scaling = 0
# Turn off the tcp_sack
net.ipv4.tcp_sack = 0
#Turn off tcp_timestamps
net.ipv4.tcp_timestamps = 0
然后 service network restart,这些都和TCP sockets有关的优化。
另外需要在 /etc/rc.d/rc.local里添加已使得重启的时候生效。
echo "30">/proc/sys/net/ipv4/tcp_fin_timeout
echo "1800">/proc/sys/net/ipv4/tcp_keepalive_time
echo "0">/proc/sys/net/ipv4/tcp_window_scaling
echo "0">/proc/sys/net/ipv4/tcp_sack
echo "0">/proc/sys/net/ipv4/tcp_timestamps
因为不是所有的程序都在root下跑的，所有linux有对hard 与soft open files 的区分，普通用户受hard的限制，无论ulimit -n $数值调到多高，都跑不到 /etc/security/limits.conf里nofile的值.
这样的优化后 lsof -p $java_pid|wc -l可以跑到4千以上都不会抛出too many open files。