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MATLAB实现HC(层次聚类)分析
MATLAB中可以使用linkage
函数来实现层次聚类分析。
首先,需要准备好数据,假设我们有一个 n 行 m 列的数据矩阵 data
,其中每行是一个样本,每列是一个特征。我们可以将每一列视为一个变量,对它们进行层次聚类分析。
接着,使用以下代码进行层次聚类分析:
% 计算相似度矩阵
dist = pdist(data); % 计算两两样本之间的欧氏距离
sim = 1 - squareform(dist); % 将距离转换为相似度
% 进行层次聚类
method = 'average'; % 设置聚类方法为平均法
Z = linkage(sim, method); % 进行聚类并得到聚类树状图
% 绘制聚类树状图
dendrogram(Z);
其中,pdist
函