Python实现txrm格式文件转换为tiff格式文件

1. 背景:

      最近在利用蔡司的X射线显微镜进行物体扫描时,想要去找到具体的投影数据,利用自己的重建算法进行重建,发现蔡司公司把这个中间投影过程全部省略了,最后只给你一个重建好后的三维图像切片文件夹,不给中间一张一张的投影切片,很是头大。

于是去根目录下找,只找到了后缀名为txrm的文件。想把它转换为matlab能够打开的通用的tiff格式的三维图像文件,费了不少力气。在此记录一下。

2. 方法:

python已经有封装好的库:txrm2tiff

GitHub - DiamondLightSource/txrm2tiff:将 txrm/xrm 文件转换为 OME tif/tiff 文件

1.安装python库:

conda install -c conda-forge txrm2tiff

或者:

python -m pip install txrm2tiff

一般第一个好用,会受到网速影响,耐心等待即可

2.打开命令行,进行格式转换

txrm2tiff --input "txrm文件路径" --output "tiff文件路径" --ignore-ref

注意这是对于文件夹的操作,可以新建文件夹。

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转载自blog.csdn.net/weixin_44603934/article/details/133755993