1、Linux的本质有三点，一是开源，二是免费，三是和Unix是一个体系。选择Unix/Linux作为服务器操作系统，是可以为企业节约很多成本的，在Linux系统下构建系统，可以保证最大的兼容性。
2、Linux自带gcc、Python、Perl、Ruby；httpd、Sendmail等一系列网络软件；CVS、Subversion、AutoMake等等。
3、Windows门槛低，界面美观，应用软件丰富，对于喜欢Photoshop的朋友，当然是非Windows不可了。软件的测试不仅要考虑到FireFox浏览器，也要考虑到IE浏览器，因此，无论如何，也少不了一台Windows.
PS：我们并不需要将所有的工作都搬到Linux平台中，在一个局域网中，只需要一台Linux就足够了，其余的都可以是Windows，Linux服务器主要用来运行Subversion，用来进行每日构建和自动化测试，而Windows则主要是用来开发，当然，也要作为客户端进行一部分的测试工作。
几乎没有区别，这个你要理解“JAVA是跨平台”的原理，本质是由于JAVA是基于jdk，jre环境下运行的，所以不论是LUNIX还是WINDOWS，有这两者的配置，即可进行JAVA编程，没什么大区别，否则就不叫跨平台了。
如果硬要说区别的话，那就是Java的相关软件（如jdk、IDE）在Linux平台下安装部署是比windows麻烦，需要设置JAVA_HOME环境变量等参数，其余就没什么差别了。