终于碰到这个问题了，
java.lang.UnsupportedClassVersionError: Bad version number in .class file
这是java的编译的版本问题，把版本改成一致的就可以了，例如jdk 和jre都设为6.0。在myeclipse的配置信息里，就分别指它的编译级别（complier）和java运行环境（install jre）.
如果是web工程，你会很意外的发现，重新启动tomcat之后，这个错误仍然存在。接着，你就在myeclipse里configure sever选择对应的tomcat ，然后选择jdk选项，把tomat使用的jdk也改过来，重新部署，重新启动tomcat，就没问题了。