Android之Apk加壳

基于ADT环境开发的的实现，请参考： Android中的Apk的加固(加壳)原理解析和实现 
类加载和dex文件相关的内容，如：Android动态加载Dex机制解析 

一、什么是加壳？

加壳是在二进制的程序中植入一段代码，在运行的时候优先取得程序的控制权，做一些额外的工作。大多数病毒就是基于此原理。是应用加固的一种手法对原始二进制原文进行加密/隐藏/混淆。
壳最本质的功能就是实现加载器。

• 未加壳前，系统直接执行原dex，即原apk
• 加壳后，系统执行 壳代码--> 脱壳得到原dex --> 执行原dex

Apk加壳：就是通过给目标APK加一层保护程序，把需要保护的内容加密、隐藏起来，来防止反编译的一种方法。
加壳的原理: 

所以我们在加壳过程中需要三个关键对象： 
1、未加密的Apk(即demo.apk) 
2、壳程序Apk(即shell.apk，负责解密apk工作) 
3、加密工具(即java工程。将demo.apk加密和shell.dex合并，得到新的dex)

二、下面我们来实现如何加壳：
Step1：打包demo工程：demo.apk
Step2（先设置解壳/密）：打包解壳工程：shell.apk，解压获取：shell.dex
Step3（开始加壳/密）：运行java工程，合并shell.dex和demo.apk，得到：classes.dex
step4（修正签名、运行）：把class.dex放进shell.apk，重新签名得到：shell_demo.apk
shell_demo.apk就是我们想得到的加壳app！


 

Step1：打包demo工程：demo.apk

注意：这里包括后续打包，只能使用同一个签名。
源码：https://github.com/lvxiangan/Shell/tree/master/Demo
功能：获取当前包名，广播监听网络状态变化，Glide框架显示网络图片（网络操作+图片显示）等。
     

关键代码

1、MyApplication

public class MyApplication extends Application {

    @Override
    public void onCreate() {
        super.onCreate();
        Log.i("demo", "apk onCreate:" + this);
    }
}

2、AndroidManifest.xml

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<manifest xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    package="demon.demo">

    <uses-permission android:name="android.permission.INTERNET" />
    <uses-permission android:name="android.permission.ACCESS_NETWORK_STATE" />

    <application
        android:name=".MyApplication"
        android:allowBackup="true"
        android:icon="@mipmap/ic_launcher"
        android:label="@string/app_name"
        android:roundIcon="@mipmap/ic_launcher_round"
        android:supportsRtl="true"
        android:theme="@style/AppTheme">
        <activity android:name=".MainActivity">
            <intent-filter>
                <action android:name="android.intent.action.MAIN" />

                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
            </intent-filter>
        </activity>
        <activity android:name=".ImageActivity" />
    </application></manifest>
 

Step2：打包解壳工程：shell.apk，解压获取：shell.dex

这个shell.apk在经过后面替换dex后，就是我们想要得到的东西。

源码：https://github.com/lvxiangan/Shell/tree/master/MyUnshell
工程目录：

通过解压shell.Apk的方式获取到dex文件,  更名为shell.dex。如图：

关键代码
1、ProxyApplication.java

import android.app.Application;
import android.app.Instrumentation;
import android.content.Context;
import android.content.pm.ApplicationInfo;
import android.content.pm.PackageManager;
import android.content.res.AssetManager;
import android.content.res.Resources;
import android.os.Bundle;
import android.util.ArrayMap;
import android.util.Log;

import java.io.BufferedInputStream;
import java.io.ByteArrayInputStream;
import java.io.ByteArrayOutputStream;
import java.io.DataInputStream;
import java.io.File;
import java.io.FileInputStream;
import java.io.FileOutputStream;
import java.io.IOException;
import java.lang.ref.WeakReference;
import java.lang.reflect.Method;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Iterator;
import java.util.zip.ZipEntry;
import java.util.zip.ZipInputStream;

import dalvik.system.DexClassLoader;

public class ProxyApplication extends Application {
    private static final String appkey = "APPLICATION_CLASS_NAME";
    private String apkFileName;
    private String odexPath;
    private String libPath;

    @Override
    protected void attachBaseContext(Context base) {
        super.attachBaseContext(base);
        try {
            // 创建两个文件夹payload_odex，payload_lib 私有的，可写的文件目录
            File odex = this.getDir("demo_odex", MODE_PRIVATE);
            File libs = this.getDir("demo_lib", MODE_PRIVATE);
            odexPath = odex.getAbsolutePath();
            libPath = libs.getAbsolutePath();

            apkFileName = odexPath + "/shelldemo.apk";
            File dexFile = new File(apkFileName);
            Log.i("demo", "apk size:" + dexFile.length());


            if (!dexFile.exists()) {
                // 在payload_odex文件夹内，创建payload.apk
                dexFile.createNewFile();
                // 读取程序classes.dex文件
                byte[] dexdata = this.readDexFileFromApk();

                // 分离出解壳后的apk文件已用于动态加载
                this.splitPayLoadFromDex(dexdata);
            }
            // 配置动态加载环境 获取主线程对象 http://blog.csdn.net/myarrow/article/details/14223493
            Object currentActivityThread = RefInvoke.invokeStaticMethod("android.app.ActivityThread", "currentActivityThread", new Class[]{}, new Object[]{});
            String packageName = this.getPackageName();//当前apk的包名
            ArrayMap mPackages = (ArrayMap) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread", currentActivityThread, "mPackages");
            WeakReference wr = (WeakReference) mPackages.get(packageName);

            //创建被加壳apk的DexClassLoader对象 加载apk内的类和本地代码（c/c++代码）
            DexClassLoader dLoader = new DexClassLoader(apkFileName, odexPath, libPath, (ClassLoader) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.LoadedApk", wr.get(), "mClassLoader"));
            //base.getClassLoader(); 是不是就等同于 (ClassLoader) RefInvoke.getFieldOjbect()? 有空验证下//?

            //把当前进程的DexClassLoader 设置成了被加壳apk的DexClassLoader
            RefInvoke.setFieldOjbect("android.app.LoadedApk", "mClassLoader", wr.get(), dLoader);

            Log.i("demo", "classloader:" + dLoader);
        } catch (Exception e) {
            Log.i("demo", "error:" + Log.getStackTraceString(e));
            e.printStackTrace();
        }
    }

    @Override
    public void onCreate() {
        //loadResources(apkFileName);
        Log.i("demo", "onCreate");

        // 如果源应用配置有Appliction对象，则替换为源应用Applicaiton，以便不影响源程序逻辑。
        String appClassName = null;
        try {
            ApplicationInfo ai = this.getPackageManager().getApplicationInfo(this.getPackageName(), PackageManager.GET_META_DATA);
            Bundle bundle = ai.metaData;
            if (bundle != null && bundle.containsKey("APPLICATION_CLASS_NAME")) {
                appClassName = bundle.getString("APPLICATION_CLASS_NAME");//className 是配置在xml文件中的。
            } else {
                Log.i("demo", "have no application class name");
                return;
            }
        } catch (PackageManager.NameNotFoundException e) {
            Log.i("demo", "error:" + Log.getStackTraceString(e));
        }
        //有值的话调用该Applicaiton
        Object currentActivityThread = RefInvoke.invokeStaticMethod("android.app.ActivityThread", "currentActivityThread", new Class[]{}, new Object[]{});
        Object mBoundApplication = RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread", currentActivityThread, "mBoundApplication");
        Object loadedApkInfo = RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread$AppBindData", mBoundApplication, "info");
        //把当前进程的mApplication 设置成了null
        RefInvoke.setFieldOjbect("android.app.LoadedApk", "mApplication", loadedApkInfo, null);
        Object oldApplication = RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread", currentActivityThread, "mInitialApplication");

        ArrayList<Application> mAllApplications = (ArrayList<Application>) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread", currentActivityThread, "mAllApplications");
        mAllApplications.remove(oldApplication);//删除oldApplication

        ApplicationInfo appinfo_In_LoadedApk = (ApplicationInfo) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.LoadedApk", loadedApkInfo, "mApplicationInfo");
        ApplicationInfo appinfo_In_AppBindData = (ApplicationInfo) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread$AppBindData", mBoundApplication, "appInfo");
        appinfo_In_LoadedApk.className = appClassName;
        appinfo_In_AppBindData.className = appClassName;
        Application app = (Application) RefInvoke.invokeMethod("android.app.LoadedApk", "makeApplication", loadedApkInfo, new Class[]{boolean.class, Instrumentation.class}, new Object[]{false, null});//执行 makeApplication（false,null）
        RefInvoke.setFieldOjbect("android.app.ActivityThread", "mInitialApplication", currentActivityThread, app);


        ArrayMap mProviderMap = (ArrayMap) RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread", currentActivityThread, "mProviderMap");
        Iterator it = mProviderMap.values().iterator();
        while (it.hasNext()) {
            Object providerClientRecord = it.next();
            Object localProvider = RefInvoke.getFieldOjbect("android.app.ActivityThread$ProviderClientRecord", providerClientRecord, "mLocalProvider");
            RefInvoke.setFieldOjbect("android.content.ContentProvider", "mContext", localProvider, app);
        }

        Log.i("demo", "app:" + app);

        app.onCreate();
    }


    /**
     * 释放被加壳的apk文件，so文件
     *
     * @param
     * @throws IOException
     */
    private void splitPayLoadFromDex(byte[] apkdata) throws IOException {
        int ablen = apkdata.length;
        //取被加壳apk的长度 这里的长度取值，对应加壳时长度的赋值都可以做些简化
        byte[] dexlen = new byte[4];
        System.arraycopy(apkdata, ablen - 4, dexlen, 0, 4);
        ByteArrayInputStream bais = new ByteArrayInputStream(dexlen);
        DataInputStream in = new DataInputStream(bais);
        int readInt = in.readInt();
        System.out.println(Integer.toHexString(readInt));
        byte[] newdex = new byte[readInt];
        //把被加壳apk内容拷贝到newdex中
        System.arraycopy(apkdata, ablen - 4 - readInt, newdex, 0, readInt);
        //这里应该加上对于apk的解密操作，若加壳是加密处理的话
        //?

        //对源程序Apk进行解密
        newdex = decrypt(newdex);

        //写入apk文件
        File file = new File(apkFileName);
        try {
            FileOutputStream localFileOutputStream = new FileOutputStream(file);
            localFileOutputStream.write(newdex);
            localFileOutputStream.close();
        } catch (IOException localIOException) {
            throw new RuntimeException(localIOException);
        }

        //分析被加壳的apk文件
        ZipInputStream localZipInputStream = new ZipInputStream(new BufferedInputStream(new FileInputStream(file)));
        while (true) {
            ZipEntry localZipEntry = localZipInputStream.getNextEntry();//不了解这个是否也遍历子目录，看样子应该是遍历的
            if (localZipEntry == null) {
                localZipInputStream.close();
                break;
            }
            //取出被加壳apk用到的so文件，放到 libPath中（data/data/包名/payload_lib)
            String name = localZipEntry.getName();
            if (name.startsWith("lib/") && name.endsWith(".so")) {
                File storeFile = new File(libPath + "/" + name.substring(name.lastIndexOf('/')));
                storeFile.createNewFile();
                FileOutputStream fos = new FileOutputStream(storeFile);
                byte[] arrayOfByte = new byte[1024];
                while (true) {
                    int i = localZipInputStream.read(arrayOfByte);
                    if (i == -1)
                        break;
                    fos.write(arrayOfByte, 0, i);
                }
                fos.flush();
                fos.close();
            }
            localZipInputStream.closeEntry();
        }
        localZipInputStream.close();


    }

    /**
     * 从apk包里面获取dex文件内容（byte）
     *
     * @return
     * @throws IOException
     */
    private byte[] readDexFileFromApk() throws IOException {
        ByteArrayOutputStream dexByteArrayOutputStream = new ByteArrayOutputStream();
        ZipInputStream localZipInputStream = new ZipInputStream(new BufferedInputStream(new FileInputStream(this.getApplicationInfo().sourceDir)));
        while (true) {
            ZipEntry localZipEntry = localZipInputStream.getNextEntry();
            if (localZipEntry == null) {
                localZipInputStream.close();
                break;
            }
            if (localZipEntry.getName().equals("classes.dex")) {
                byte[] arrayOfByte = new byte[1024];
                while (true) {
                    int i = localZipInputStream.read(arrayOfByte);
                    if (i == -1)
                        break;
                    dexByteArrayOutputStream.write(arrayOfByte, 0, i);
                }
            }
            localZipInputStream.closeEntry();
        }
        localZipInputStream.close();
        return dexByteArrayOutputStream.toByteArray();
    }


    // //直接返回数据，读者可以添加自己解密方法
    private byte[] decrypt(byte[] srcdata) {
        for (int i = 0; i < srcdata.length; i++) {
            srcdata[i] = (byte) (0xFF ^ srcdata[i]);
        }
        return srcdata;
    }


    //以下是加载资源
    protected AssetManager mAssetManager;//资源管理器
    protected Resources mResources;//资源
    protected Resources.Theme mTheme;//主题


    protected void loadResources(String dexPath) {
        try {
            AssetManager assetManager = AssetManager.class.newInstance();
            Method addAssetPath = assetManager.getClass().getMethod("addAssetPath", String.class);
            addAssetPath.invoke(assetManager, dexPath);
            mAssetManager = assetManager;
        } catch (Exception e) {
            Log.i("inject", "loadResource error:" + Log.getStackTraceString(e));
            e.printStackTrace();
        }
        Resources superRes = super.getResources();
        superRes.getDisplayMetrics();
        superRes.getConfiguration();
        mResources = new Resources(mAssetManager, superRes.getDisplayMetrics(), superRes.getConfiguration());
        mTheme = mResources.newTheme();
        mTheme.setTo(super.getTheme());
    }

    @Override
    public AssetManager getAssets() {
        return mAssetManager == null ? super.getAssets() : mAssetManager;
    }

    @Override
    public Resources getResources() {
        return mResources == null ? super.getResources() : mResources;
    }

    @Override
    public Resources.Theme getTheme() {
        return mTheme == null ? super.getTheme() : mTheme;
    }

}

2.RefInvoke.java

import java.lang.reflect.Field;
import java.lang.reflect.InvocationTargetException;
import java.lang.reflect.Method;

public class RefInvoke {
    /**
     * 反射执行类的静态函数(public)
     *
     * @param class_name  类名
     * @param method_name 函数名
     * @param pareTyple   函数的参数类型
     * @param pareVaules  调用函数时传入的参数
     * @return
     */
    public static Object invokeStaticMethod(String class_name, String method_name, Class[] pareTyple, Object[] pareVaules) {

        try {
            Class obj_class = Class.forName(class_name);
            Method method = obj_class.getMethod(method_name, pareTyple);
            return method.invoke(null, pareVaules);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
        return null;

    }

    /**
     * 反射执行类的函数（public）
     *
     * @param class_name
     * @param method_name
     * @param obj
     * @param pareTyple
     * @param pareVaules
     * @return
     */
    public static Object invokeMethod(String class_name, String method_name, Object obj, Class[] pareTyple, Object[] pareVaules) {

        try {
            Class obj_class = Class.forName(class_name);
            Method method = obj_class.getMethod(method_name, pareTyple);
            return method.invoke(obj, pareVaules);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
        return null;

    }

    /**
     * 反射得到类的属性（包括私有和保护）
     *
     * @param class_name
     * @param obj
     * @param filedName
     * @return
     */
    public static Object getFieldOjbect(String class_name, Object obj, String filedName) {
        try {
            Class obj_class = Class.forName(class_name);
            Field field = obj_class.getDeclaredField(filedName);
            field.setAccessible(true);
            return field.get(obj);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
        return null;

    }

    /**
     * 反射得到类的静态属性（包括私有和保护）
     *
     * @param class_name
     * @param filedName
     * @return
     */
    public static Object getStaticFieldOjbect(String class_name, String filedName) {

        try {
            Class obj_class = Class.forName(class_name);
            Field field = obj_class.getDeclaredField(filedName);
            field.setAccessible(true);
            return field.get(null);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
        return null;

    }

    /**
     * 设置类的属性（包括私有和保护）
     *
     * @param classname
     * @param filedName
     * @param obj
     * @param filedVaule
     */
    public static void setFieldOjbect(String classname, String filedName, Object obj, Object filedVaule) {
        try {
            Class obj_class = Class.forName(classname);
            Field field = obj_class.getDeclaredField(filedName);
            field.setAccessible(true);
            field.set(obj, filedVaule);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }

    /**
     * 设置类的静态属性（包括私有和保护）
     *
     * @param class_name
     * @param filedName
     * @param filedVaule
     */
    public static void setStaticOjbect(String class_name, String filedName, Object filedVaule) {
        try {
            Class obj_class = Class.forName(class_name);
            Field field = obj_class.getDeclaredField(filedName);
            field.setAccessible(true);
            field.set(null, filedVaule);
        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }

}

3、根据demo的 AndroidManifest.xml ，配置shell工程AndroidManifest.xml
注意：

• 把demo.apk的AndroidManifest.xml中所有：权限、组件（activity、service、broadcastreceiver） 复制过来，组件必须使用完整的包名。 
• 使用meta-data配置 demo.apk 的MyApplication，也要使用完整包名。 

注意对比两个配置文件的区别。
解壳工程：
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<manifest xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    package="demon.myunshell">

    <uses-permission android:name="android.permission.INTERNET" />
    <uses-permission android:name="android.permission.ACCESS_NETWORK_STATE" />

    <application
        android:name=".ProxyApplication"
        android:allowBackup="true"
        android:icon="@mipmap/ic_launcher"
        android:label="@string/app_name"
        android:theme="@style/AppTheme">
        <meta-data
            android:name="APPLICATION_CLASS_NAME"
            android:value="demon.demo.MyApplication" />

        <activity android:name="demon.demo.MainActivity">
            <intent-filter>
                <action android:name="android.intent.action.MAIN" />
                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
            </intent-filter>
        </activity>
        <activity android:name="demon.demo.ImageActivity" />
    </application>

</manifest>

demo工程：
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<manifest xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
    package="demon.demo">

    <uses-permission android:name="android.permission.INTERNET" />
    <uses-permission android:name="android.permission.ACCESS_NETWORK_STATE" />

    <application
        android:name=".MyApplication"
        android:allowBackup="true"
        android:icon="@mipmap/ic_launcher"
        android:label="@string/app_name"
        android:roundIcon="@mipmap/ic_launcher_round"
        android:supportsRtl="true"
        android:theme="@style/AppTheme">
        <activity android:name=".MainActivity">
            <intent-filter>
                <action android:name="android.intent.action.MAIN" />
                <category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
            </intent-filter>
        </activity>
        <activity android:name=".ImageActivity" />
    </application>

</manifest>

 

Step3：运行java工程，合并shell.dex和demo.apk，得到：classes.dex

源码：https://github.com/lvxiangan/Shell/tree/master/DexShellTool
这是一个java工程，目录结构如下：

工程下新建force文件夹，将demo.apk，shell.dex复制到里面去，运行如下代码,生成新的dex文件，即classes.dex：

加密合并成功后的classes.dex，大小几乎等于demo.apk + shell.dex。

关键代码：
public class DexShellTool {
    /**
     * @param args
     */
    public static void main(String[] args) {
        // TODO Auto-generated method stub
        try {
            File payloadSrcFile = new File("force/demo.apk");   //需要加壳的程序
            System.out.println("apk size:"+payloadSrcFile.length());
            File unShellDexFile = new File("force/shell.dex");    //解壳dex
            byte[] payloadArray = encrpt(readFileBytes(payloadSrcFile));//以二进制形式读出apk，并进行加密处理//对源Apk进行加密操作
            byte[] unShellDexArray = readFileBytes(unShellDexFile);//以二进制形式读出dex
            int payloadLen = payloadArray.length;
            int unShellDexLen = unShellDexArray.length;
            int totalLen = payloadLen + unShellDexLen +4;//多出4字节是存放长度的。
            byte[] newdex = new byte[totalLen]; // 申请了新的长度
            //添加解壳代码
            System.arraycopy(unShellDexArray, 0, newdex, 0, unShellDexLen);//先拷贝dex内容
            //添加加密后的解壳数据
            System.arraycopy(payloadArray, 0, newdex, unShellDexLen, payloadLen);//再在dex内容后面拷贝apk的内容
            //添加解壳数据长度
            System.arraycopy(intToByte(payloadLen), 0, newdex, totalLen-4, 4);//最后4为长度
            //修改DEX file size文件头
            fixFileSizeHeader(newdex);
            //修改DEX SHA1 文件头
            fixSHA1Header(newdex);
            //修改DEX CheckSum文件头
            fixCheckSumHeader(newdex);

            String str = "force/classes.dex";
            File file = new File(str);
            if (!file.exists()) {
                file.createNewFile();
            }

            FileOutputStream localFileOutputStream = new FileOutputStream(str);
            localFileOutputStream.write(newdex);
            localFileOutputStream.flush();
            localFileOutputStream.close();

        } catch (Exception e) {
            e.printStackTrace();
        }
    }

    //直接返回数据，读者可以添加自己加密方法
    private static byte[] encrpt(byte[] srcdata){
        for(int i = 0;i<srcdata.length;i++){
            srcdata[i] = (byte)(0xFF ^ srcdata[i]);
        }
        return srcdata;
    }

    /**
     * 修改dex头，CheckSum 校验码
     * @param dexBytes
     */
    private static void fixCheckSumHeader(byte[] dexBytes) {
        Adler32 adler = new Adler32();
        adler.update(dexBytes, 12, dexBytes.length - 12);//从12到文件末尾计算校验码
        long value = adler.getValue();
        int va = (int) value;
        byte[] newcs = intToByte(va);
        //高位在前，低位在前掉个个
        byte[] recs = new byte[4];
        for (int i = 0; i < 4; i++) {
            recs[i] = newcs[newcs.length - 1 - i];
            System.out.println(Integer.toHexString(newcs[i]));
        }
        System.arraycopy(recs, 0, dexBytes, 8, 4);//效验码赋值（8-11）
        System.out.println(Long.toHexString(value));
        System.out.println();
    }

    /**
     * int 转byte[]
     * @param number
     * @return
     */
    public static byte[] intToByte(int number) {
        byte[] b = new byte[4];
        for (int i = 3; i >= 0; i--) {
            b[i] = (byte) (number % 256);
            number >>= 8;
        }
        return b;
    }

    /**
     * 修改dex头 sha1值
     * @param dexBytes
     * @throws NoSuchAlgorithmException
     */
    private static void fixSHA1Header(byte[] dexBytes)
            throws NoSuchAlgorithmException {
        MessageDigest md = MessageDigest.getInstance("SHA-1");
        md.update(dexBytes, 32, dexBytes.length - 32);//从32为到结束计算sha--1
        byte[] newdt = md.digest();
        System.arraycopy(newdt, 0, dexBytes, 12, 20);//修改sha-1值（12-31）
        //输出sha-1值，可有可无
        String hexstr = "";
        for (int i = 0; i < newdt.length; i++) {
            hexstr += Integer.toString((newdt[i] & 0xff) + 0x100, 16)
                    .substring(1);
        }
        System.out.println(hexstr);
    }

    /**
     * 修改dex头 file_size值
     * @param dexBytes
     */
    private static void fixFileSizeHeader(byte[] dexBytes) {
        //新文件长度
        byte[] newfs = intToByte(dexBytes.length);
        System.out.println(Integer.toHexString(dexBytes.length));
        byte[] refs = new byte[4];
        //高位在前，低位在前掉个个
        for (int i = 0; i < 4; i++) {
            refs[i] = newfs[newfs.length - 1 - i];
            System.out.println(Integer.toHexString(newfs[i]));
        }
        System.arraycopy(refs, 0, dexBytes, 32, 4);//修改（32-35）
    }

    /**
     * 以二进制读出文件内容
     * @param file
     * @return
     * @throws IOException
     */
    private static byte[] readFileBytes(File file) throws IOException {
        byte[] arrayOfByte = new byte[1024];
        ByteArrayOutputStream localByteArrayOutputStream = new ByteArrayOutputStream();
        FileInputStream fis = new FileInputStream(file);
        while (true) {
            int i = fis.read(arrayOfByte);
            if (i != -1) {
                localByteArrayOutputStream.write(arrayOfByte, 0, i);
            } else {
                return localByteArrayOutputStream.toByteArray();
            }
        }
    }
}
 

step4：把class.dex放进shell.apk，重新签名得到：shell_demo.apk

素材下载：https://github.com/lvxiangan/Shell/tree/master/Tools

解压step2的shell.apk

• 将step3得到的classes.dex替换classes.dex。 
• 重新签名

完成后，如下图：

注意观察classes.dex的大小，判断是否复制成功。

开始重新签名：

• 新建一个Tools文件夹，将前面的签名文件，shell.apk复制进去。 
• 签名命令太长不好记，我们新建sign.bat文件，添加如下内容，注意使用该命令系统必须配置Java环境变量，可根据自身情况进行修改，方便下次使用：

jarsigner -verbose -keystore DeMon.jks -storepass 123456 -keypass 123456 -sigfile CERT -digestalg SHA1 -sigalg MD5withRSA -signedjar shelldemo.apk shell.apk key

命令说明：
jarsigner -verbose -keystore 签名文件 -storepass 密码  -keypass alias的密码 -sigfile CERT -digestalg SHA1 -sigalg MD5withRSA  签名后的文件 签名前的apk alias名称

•  

• 双击运行sign.bat文件，成功签名Tools文件会新增一个shelldemo.apk，会比shell.apk稍大，大概就是生成的签名文件的大小。shelldemo.apk就是成功加壳后的apk，可以安装运行。

正确签名后的内容如下：

step5：验证效果
  

注意对比demo.apk的效果图，除了标题和包名与不一致外，功能上完全相同，即符合预期。Apk加壳成功!

总结

优点不多述，说说缺点吧： 
1、 Apk体积变大，尤其是res文件成倍增长。 
2、解壳过程容易被反编译，最好用C/C++实现
3、第一次安装启动需要等待加载时间较长，用户体验不好。

GitHub地址：
https://github.com/lvxiangan/Shell

改进版：https://github.com/lvxiangan/Android-Shell2
1、解决加壳后运行有两个app的问题、
2、在一个AS工程管理各个模块，打包输出时记得选择切换模块
3、在壳程序实现JNI解密



参考：https://blog.csdn.net/DeMonliuhui/article/details/78269234