科研日常中会在Linux系统下使用到很多shell 命令，有很多十分有用的命令。当要实现一个功能时，可能需要非常简单的几个单词和字母即可，在此将自己常用的命令做一总结，方便查阅。
1. 选取命令cut
cut主要用来对同一行里的数据进行分解，对字符串切割。
cut -d '分割字符' -f fields #用于分割字符；
cut -c 字符范围 #用于分割排列整齐的信息；
举例：
$ a=123:456:789
$ echo $a | cut -d ':' -f 2
456
$ b=`echo $a | cut -d ':' -f 2` ; echo $b
456
$ c=` echo $a | cut -b 5-7` ; echo $c
456
$ echo $a | cut -c 5-7
456
2. 查找命令grep
grep主要用来查找，若有需要的信息，则会查找出来；
grep [-acinv] [--color=auto] '查找字符串' filename
-a: 将binary文件以text文件的方式进行查找数据；
-c: 计算找到‘查找字符串‘的次数；
-i: 忽略大小写；
-n: 输出行号；
-v: 反向选择，即显示出没有查找字符串的行；
--color=auto: 将找到的关键字用颜色显示；
举例：
文件data.txt内容如下：
001 liming 1995 aaa
002 lily 1988 aaa
003 danilise 1999 bbb
004 david 2003 bbb
$ grep 'aaa' data.txt #输出查找到的内容；
001 liming 1995 aaa
002 lily 1988 aaa
$ grep -c 'aaa' data.txt #输出查找到的个数；
2
$ grep -n 'aaa' data.txt #加上行号；
1:001 liming 1995 aaa
2:002 lily 1988 aaa
$ cat data.txt | grep 'bbb'
003 danilise 1999 bbb
004 david 2003 bbb
cut与grep联合使用
举例：
$ cat data.txt | grep 'bbb' | cut -d ' ' -f2
danilise
david