个人认为：
Jquery Mobile的初衷直接将原生app替换掉，而
Bootstrap3的目的是将桌面上的网站直接迁移到移动终端。所以JM界面更接近于原生APP的UI ，而
Bootstrap3的UI更接近于桌面浏览器的前端界面更像一个网站，而不像一个APP.
做网站首页导引时使用Bootstrap3可以实现很好的浏览效果，并且可以直接无缝地在移动终端进行流量。而进行APP开发时，最好使用JM，他的UI更接近原生UI，同时他的页面导航机制使它更像APP，而不是跳转到一个网页
http://note.youdao.com/share/?id=1563616c29c6f6351893465119a1c640&type=note