一般出现在从别处import的项目上，只有项目文件夹上有红叉，其他地方都正常，现总结个人的几个解决方案，有几种可能：
1、 编码设置是否一致，也即是你项目原来的编码和现在eclipse用的默认编码是否一致
2、导入项目中jar路径可能已经被改变，多数情况下都是这个原因造成，我也曾经遇见过，你要确保你的jar包路径都没问题。myeclipse有查看jar路径的视图你可切换看看，报红X的就都是路径被改动过的，重新加进来就OK。
3、在problem控制台里有如下错误提示：Java compiler level does not match the version of the installed Java project facet。这种情况一般可以在项目上右键-->properties-->然后找到project facets和 Java Compiler两个选项，修改其使用的jdk版本即可。如果没有找到project facets选项，可以参考下面的方法：
当你安装了两个版本的JDK，用了两个IDE开发工具，比如两个myeclipse，Myeclipse8.5和Myeclipse9.0。
这时候涉及到了jdk版本的问题，而在Myeclipse中设置是比较隐藏的。
Eclipse下有个项目报如上错误，这个是因为Facted Project 中的Java 版本设定与项目的Java 版本设定不一致。而如果使用的是MyEclipse的话，这个配置修改起来就不是很方便，具体方法稍后再说。如果是eclipse jee版本，则使用javaee插件是wtp，在wtp环境在，在当前项目上点右键，属性--Project Facets中，配置编译版本与java compiler的版本一致，问题即解决了。
MyEclipse中没有Project Facets配置选项，则需要到当前项目的.settings文件夹下，找到org.eclipse.wst.common.project.facet.core.xml文件，其内容如下：
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<faceted-project>
<fixed facet="wst.jsdt.web"/>
<installed facet="java" version="1.6"/>
<installed facet="jst.web" version="2.5"/>
<installed facet="wst.jsdt.web" version="1.0"/>
</faceted-project>
其中<installed facet="java" version="1.6"/>这行就是faceted project的编译级别配置。<installed facet="jst.web" version="2.5"/>这行配置在某些情况下也需要修改，比如在MyEclipse中建了个web项目，后来又导入到eclipse jee，有时候就需要修改这个配置。
保存配置后，刷新并build项目后，问题解决。