官方已经给出了解决方案
1、下载替换包链接地址：
https://github.com/tofi86/universalJavaApplicationStub/archive/v3.0.6.zip
https://github.com/tofi86/universalJavaApplicationStub/archive/v3.0.6.tar.gz
2、解压压缩包进入src目录下，将此文件加上.sh后缀
3、替换JD-GUI包下的文件
右击JD-GUI显示包内容
4、进入目录Contents->MacOS
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5、替换此文件即可。
熟悉的界面回来了。
不想自行替换的小伙伴可以点击此链接下载