NeuroRA 项目教程

NeuroRA 项目教程

NeuroRA A Python Toolbox for Multimode Neural Data Representation Analysis - A Representational Analysis Toolbox for Neuroscience, including Neural Pattern Similarity (NPS), Representational Similarity Analysis (RSA), Spatiotemporal Pattern Similarity (STPS) & Inter-Subject Correlation (ISC) NeuroRA 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ne/NeuroRA

1. 项目的目录结构及介绍

NeuroRA 项目的目录结构如下:

NeuroRA/
├── build/
│   └── lib/
│       └── neurora/
├── demo/
├── dist/
├── docs/
├── img/
├── neurora/
│   ├── __init__.py
│   ├── ...
├── test/
├── LICENSE
├── README.md
├── _config.yml
├── index.md
├── setup.py

目录结构介绍

  • build/: 包含编译后的库文件。
  • demo/: 包含项目的演示文件,包括 .py.ipynb 文件。
  • dist/: 包含项目的分发文件。
  • docs/: 包含项目的文档文件。
  • img/: 包含项目文档中使用的图片文件。
  • neurora/: 项目的主要代码文件夹,包含核心功能实现。
  • test/: 包含项目的测试文件。
  • LICENSE: 项目的许可证文件。
  • README.md: 项目的介绍文件。
  • _config.yml: 项目的配置文件。
  • index.md: 项目的主页文件。
  • setup.py: 项目的安装脚本。

2. 项目的启动文件介绍

NeuroRA 项目的启动文件是 setup.py。这个文件用于安装项目所需的依赖项,并设置项目的运行环境。

setup.py 文件介绍

from setuptools import setup, find_packages

setup(
    name='neurora',
    version='1.1.4',
    packages=find_packages(),
    install_requires=[
        'numpy',
        'scipy',
        'scikit-learn',
        'matplotlib',
        'nibabel',
        'nilearn',
        'mne'
    ],
    author='Zitong Lu',
    author_email='[email protected]',
    description='A Python Toolbox for Multimode Neural Data Representation Analysis',
    long_description=open('README.md').read(),
    long_description_content_type='text/markdown',
    url='https://github.com/ZitongLu1996/NeuroRA',
    license='MIT',
    classifiers=[
        'License :: OSI Approved :: MIT License',
        'Programming Language :: Python :: 3',
        'Programming Language :: Python :: 3.6',
        'Programming Language :: Python :: 3.7',
        'Programming Language :: Python :: 3.8',
    ],
)

启动步骤

  1. 克隆项目到本地:

    git clone https://github.com/ZitongLu1996/NeuroRA.git
    
  2. 进入项目目录:

    cd NeuroRA
    
  3. 安装项目依赖:

    pip install .
    

3. 项目的配置文件介绍

NeuroRA 项目的配置文件是 _config.yml。这个文件用于配置项目的文档生成工具(如 Jekyll)。

_config.yml 文件介绍

title: NeuroRA
description: A Python Toolbox for Multimode Neural Data Representation Analysis
baseurl: ""
url: "https://zitonglu1996.github.io/NeuroRA/"
github_username: ZitongLu1996

配置文件说明

  • title: 项目的标题。
  • description: 项目的描述。
  • baseurl: 项目的基URL。
  • url: 项目的完整URL。
  • github_username: 项目作者的GitHub用户名。

通过以上步骤,您可以成功安装和配置 NeuroRA 项目,并开始使用其提供的功能。

NeuroRA A Python Toolbox for Multimode Neural Data Representation Analysis - A Representational Analysis Toolbox for Neuroscience, including Neural Pattern Similarity (NPS), Representational Similarity Analysis (RSA), Spatiotemporal Pattern Similarity (STPS) & Inter-Subject Correlation (ISC) NeuroRA 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ne/NeuroRA

猜你喜欢

转载自blog.csdn.net/gitblog_00383/article/details/142838625