scRNA-seq不同数据读入方式总结-Scanpy 篇

只有一个表达矩阵时的读入方法(参考知乎https://zhuanlan.zhihu.com/p/376856128):

import pandas as pd
import Scanpy as sc
expression_matrix = pd.read_table('···/gene_expression_matrix.txt')
expression_matrix=pd.DataFrame(expression_matrix.values.T,index=expression_matrix.columns