HMMER 项目教程
项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/hm/hmmer 1. 项目的目录结构及介绍
HMMER 项目的目录结构如下：
hmmer/
├── autobuild/
├── contrib/
├── documentation/
├── libdivsufsort/
├── profmark/
├── release-notes/
├── src/
├── test-speed/
├── testsuite/
├── tutorial/
├── .gitignore
├── .travis.yml
├── INSTALL
├── LICENSE
├── Makefile
├── README.md
├── config.guess
├── config.sub
├── configure.ac
├── install-sh
├── makeTAGS.sh
目录介绍：
- autobuild/: 自动构建相关的文件。
- contrib/: 贡献者提供的额外工具和脚本。
- documentation/: 项目文档，包括用户指南等。
- libdivsufsort/: 用于后缀数组排序的库。
- profmark/: 用于性能测试的基准数据。
- release-notes/: 发布版本的更新日志。
- src/: 项目的主要源代码。
- test-speed/: 用于速度测试的脚本和数据。
- testsuite/: 项目的测试套件。
- tutorial/: 项目的教程和示例。
- .gitignore: Git 忽略文件列表。
- .travis.yml: Travis CI 配置文件。
- INSTALL: 安装指南。
- LICENSE: 项目许可证。
- Makefile: 项目的 Makefile。
- README.md: 项目介绍和基本信息。
- config.guess: 自动检测系统配置的脚本。
- config.sub: 自动检测系统配置的脚本。
- configure.ac: 自动配置脚本。
- install-sh: 安装脚本。
- makeTAGS.sh: 生成 TAGS 文件的脚本。
2. 项目的启动文件介绍
HMMER 项目的启动文件主要位于 src/ 目录下。主要的可执行文件包括：
- src/hmmbuild: 用于构建 HMM 模型的工具。
- src/hmmsearch: 用于搜索 HMM 模型的工具。
- src/hmmscan: 用于扫描 HMM 模型的工具。
这些文件是 HMMER 项目的主要入口点，用户可以通过这些工具进行生物序列分析。
3. 项目的配置文件介绍
HMMER 项目的配置文件主要包括以下几个：
- configure.ac: 自动配置脚本，用于生成
configure脚本。 - Makefile: 项目的 Makefile，定义了项目的编译规则和依赖关系。
- INSTALL: 安装指南，提供了详细的安装步骤和说明。
- README.md: 项目介绍和基本信息，包含了项目的概述和使用说明。
这些配置文件帮助用户了解项目的构建和安装过程，并提供了必要的指导。
通过以上内容，您可以了解 HMMER 项目的目录结构、启动文件和配置文件的基本信息。希望这份教程对您有所帮助！