在matlab中如果你的代码很重要，需要加密，目前我查到了两种方法：一、生成p文件；二、生成.exe文件
matlab生成p文件的方法很简单，在command wondow里面用
pcode yourfile.m
命令可以将M文件转化为对应的pcode文件yourfile.p，据说是不会被反编译的。
一、生成p文件
P文件是对应M文件的一种预解析版本（preparsed version）。因为当你第一次执行M文件时，Matlab需要将其解析（parse）一次（第一次执行后的已解析内容会放入内存作第二次执行时使用， 即第二次执行时无需再解析），这无形中增加了执行时间。所以我们就预先作解释，那么以后再使用该M文件时，便会直接执行对应的已解析版本，即P文件。但又 因为Matlab的解析速度非常快，一般不用自己作预解析。只有当一些程序要调用到非常多的M文件时，如GUI应用程序时，才会作预解析，以增加以后的调 用速度。
如Matlab的当前目录（Current Directory）有test.m文件，其中a=1,b=2，作预解析后，又有test.p文件。因为P文件的调用优先级比M文件要高，所以当你调用test时，会作优先选 择而调用了test.p。
可以修改test.m的代码为：
% ----------------------
% test.m
a = 3;
b = 4;
% ----------------------
再在Command Window里调用test：
>> test
Warning: P-file C:\Program Files\MATLAB71\work\test.p is older than M-file C:\Program Files\MATLAB71\work\test.m.
C:\Program Files\MATLAB71\work\test.p may be obsolete and may need to be regenerated.
Type "help pcode" for information about generating P-files from M-files.
会出现一个Warning，警告你所调用的P文件比同名的M文件要旧，即表示M文件已被修改了。尽管 如此，调用的还是旧的P文件，即得出a = 1和 b = 2。
P文件可以用来作保密代码之用，如果你给别人一个M文件，别人可以打开来看到你所 有的代码和算法。如果你的代码不想被别人看到，那可以给他P文件。
pcode函数也可以应用在M函数文件。
p文件是加密文件，只能运行，不能还原成m文件的。
二、生成.exe文件加密
他的缺点是不能够脱离Matlab单独运行，必须还在command window里面调用，可移植性不强。如果生成.exe文件就可以解决这个问题。
生成.exe文件的方法稍微复杂点：
1、首先要保证你的程序是函数型的，而不是脚本形式的。如果是脚本形式的也不要紧，只需要在脚本文件第一行添加 function []=name()即可。
2、然后，在command window里用mcc -m -B sgl file.m命令生成.exe文件，期间会让你选择编译器（我的是VC6.0），会发现生成了一堆文件。
3、将上步生成的那一堆文件一起拷到待运行的机器。此时仍需matlab所必需的动态连接库。将 <matlab path >/extern/lib/win32/mglinstallar.exe拷贝到到待运行机器上。
4.在待运行的机器上先运行mglinstallar.exe, 然后选择解压目录，将在将在指定目录下解压缩出bin和toolbox两个子目录，其中在bin\win32目录下就是数学库和图形库脱离MATLAB运行所需的所有动态连接库，共有n个。可以将这些.dll考入system32, 也可以直接放在应用程序目录下（我把它拷在应用程序目录下了）。而toolbox目录则必须与应用程序同一目录。
5.大功告成，双击.exe即可运行了。
总结：两种方法都可以达到保护源代码的目的，但是各有各的优缺点。生成p文件的优点是方法简单，生成文件大小只是源代码的3倍左右，缺点是不能脱离matlab环境运行。生成.exe文件的优点是可以脱离matlab单独运行，缺点是生成的文件大小是原来的几千倍（5555555555，当然包含那些.dll文件，体积最庞大的一部分）。就拿我的程序做个比较，源码是8.34K，生成p文件22.6K，生成可执行文件（含那些.dll）共30多兆。
参考资料：
2、对于MATLAB M文件怎么加密