从peak到序列

1 打开网址

http://cistrome.org/db/#/

2 选择细胞系和组蛋白，进入基因组浏览器

image.png

3 看峰

image.png

image.png

4 去NCBI下载序列

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=genome

输入坐标：

image.png

image.png

得到序列：

>gi|568815587|ref|NC_000011.10|:117987686-117988171 Homo sapiens chromosome 11, GRCh38.p12 Primary Assembly
AGAGTAGAGCTAGGAATTGGTATTGAGTATCTCTCCTCGGAGCTACAGGTGCCAGCTCTTGTGGGGATGT
CCTCAGCCATGTGTAGAGCCAGAGCTGATTTATTCCATCTGTCCTTGCCCAGCCAGAGGTTGGACATCTG
GCTATAGGCAAAGCCCTCCCAGAAACTAGGGAATGAGGCAAGCACTTAGCTTGGGGAGCCCAGGAGACCT
ATGAAGAGAAGGAGGCAGATGTCAGCAAGCAGGCTGTCTGTGTACTTAGTGAGGTGGCTTTGAGCTGGAG
CCTGGGCCAAGCCAGGGTGGGGATCAGGTGTGTGGATGGGGCCAAGCCTAGGAATAGTGCTAGAGCAGGG
ACAGGGATTGGGCAGAGCCAGGGACTAACACATCTGAGAGCTCATTGCCAACTTGCTTAGCCCTCGGCCC
CTGCCTTCTTCCCTGGTAGGCATCAGACTCAGCTTGGCTCTTCTCAGCCCCCACTGCAGCTTCTGA

注意如果基因是在反向序列上，则要取互补序列。拿到序列去设计引物，进行chip-qPCR。