Langage R et analyse des données (6) - Installation du package R

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Génétique. Le package R

est fourni dans la sous- catégorie Génétique. Pour les données biologiques, le package Bioconductor est plus important. Il est utilisé pour traiter les données biologiques et a été développé par l'un des auteurs de R.

• Nous pouvons voir que tant de packs d'extension de R ont considérablement étendu les fonctions de R, ce qui fait que R peut être appliqué à tous les horizons, mais tant de packs d'extension ne sont pas faciles pour les novices à trouver des packs d'extension appropriés, car les packages R le sont aussi Il y en a plus, et de nombreuses fonctions sont similaires, et la dénomination n'est pas standardisée.L'apprentissage de nombreux packages R est plus compliqué que l'apprentissage de R lui-même, ce qui augmente considérablement le coût d'apprentissage de R
• Nous ne pouvons maîtriser que l'apprentissage de base R d'abord, puis maîtriser le package d'extension R en pratique
• Chaque package d'extension équivaut à une application du téléphone mobile. Nous pouvons installer différentes applications pour étendre les fonctions du système, mais l'installation du package R n'est pas aussi simple que l'installation de l'Appstore

Installation du pack d'extension R

Il existe deux façons d'installer le package R

1.Installation en ligne en réseau(Recommandé, car les dépendances entre les packages peuvent être résolues automatiquement, la plupart des packages peuvent être effectués avec une seule commande)

• Utiliser la fonction:install.packages (le nom du package)

• La première fois que vous utilisez la fonction install.packages (), vous serez invité à choisir un site miroir. Le responsable R a un site CRAN. L'exécution de cette commande sans paramètres affichera une liste des sites miroirs CRAN. Sélectionnez simplement l'un des sites miroirs.
  

• Après avoir sélectionné, vous verrez une liste de tous les packages disponibles
  
  Les chaînes de R doivent être entre guillemets, sinon une erreur sera signalée
  
  Téléchargement et installation automatiques ...
  
  
  Parfois, le site miroir peut ne pas être accessible. Pour le moment, nous devons modifier le site miroir par défaut.
  L'installation en ligne installera le package R dans le répertoire par défaut du logiciel, afin qu'il soit plus facile de appeler le paquet
  La fonction .libPaths () peut afficher l'emplacement de la bibliothèque
  
  == library () == Sans aucun paramètre, il peut afficher les packages d'installation dans la bibliothèque.
  La plupart des packages R peuvent être installés avec succès via une installation en ligne, et les packages de dépendances requis peuvent être installés automatiquement, et seuls quelques-uns doivent être installé à l'avance. De bons packages de dépendances peuvent être installés automatiquement

2.Installer à partir du code source（Linux）

• En règle générale, pour la sécurité sur le serveur, vous ne pouvez utiliser la méthode d'installation du code source que si vous ne pouvez pas accéder au réseau.

• Tout d'abord, allez sur le site officiel ou le site miroir de R pour télécharger le code source du package R requis
  

• Ensuite, vous devez porter une attention particulière au problème de dépendance. Si vous connaissez la dépendance à l'avance, vous devez d'abord télécharger le package dépendant, puis le télécharger sur le serveur. Vous pouvez l'utiliserRcmdinstallCommande à installer
  

• Installez "ABC Analysis", ce package doit dépendre du package "plottrix"