conda学习贴

这是一个conda学习贴，记录了我从接触conda到解决各种问题的过程。

1.anaconda下载后安装

1. cd 到所在路径
2. 赋予权限：
   chmod u+x Anaconda.sh
3. ./Anaconda.sh
4. 创建环境：
   conda create -n XXX
5. 激活进入：
   conda activate XXX

2.报错：Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.

#尝试修改flexiblility

conda config --add channels conda-forge
conda config --set channel_priority flexible

#其实不管报错也可能成功安装

3.创建了一个python2的母环境，以后可以无限使用

conda create -n py2

#复制到新环境
conda create -n newenv --clone py2

#如果需要可以删除旧环境
conda remove -n oldenv --all

4.安装软件包

#一般来说
conda install pgname 
#或者
conda install -c bioconda pgname

#如果安装过程过于缓慢，可以先找到包的路径
#参考：[Anaconda找包](https://blog.csdn.net/Erice_s/article/details/80156191)
#以biopython为例
anaconda search -t conda biopython
anaconda show anaconda/biopython
conda install --channel https://conda.anaconda.org/anaconda biopython

ADD.如果想要离线下载

nohup conda install -y software &

ADD. 在镜像中下载安装包并离线安装

#将下载好的安装包拷贝到~/Anaconda3/pkgs/
conda install --use-local software.gz