MAP4 项目使用教程
map4 The MinHashed Atom Pair fingerprint of radius 2 
项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ma/map4
1. 项目目录结构及介绍
map4/
├── Extended-Benchmark/
│ └── 包含用于扩展Riniker等人指纹基准测试的化合物和查询列表
├── MAP4-Similarity-Search/
│ └── 包含相似性搜索应用的源代码
├── map4/
│ ├── __init__.py
│ ├── map4.py
│ └── 其他相关文件
├── .gitignore
├── LICENSE.md
├── README.md
├── environment.yml
├── setup.py
└── test.py
目录结构介绍
- Extended-Benchmark: 包含用于扩展Riniker等人指纹基准测试的化合物和查询列表。
- MAP4-Similarity-Search: 包含相似性搜索应用的源代码。
- map4: 包含MAP4指纹的源代码。
- .gitignore: Git忽略文件，指定哪些文件或目录不需要被Git管理。
- LICENSE.md: 项目的许可证文件，采用MIT许可证。
- README.md: 项目的说明文件，包含项目的概述、安装和使用说明。
- environment.yml: Conda环境配置文件，用于创建项目的运行环境。
- setup.py: 项目的安装脚本，用于通过pip安装项目。
- test.py: 项目的测试脚本，用于测试MAP4指纹的功能。
2. 项目启动文件介绍
map4.py
map4.py 是MAP4项目的主要启动文件。它包含了MAP4指纹的实现代码，可以通过命令行或Python脚本调用。
使用方法
python map4.py -i smilesfile.smi -o outputfile
-i: 输入文件，包含SMILES格式的化合物数据。-o: 输出文件，用于存储生成的MAP4指纹。
test.py
test.py 是项目的测试脚本，用于测试MAP4指纹的功能。它包含了多个测试用例，确保MAP4指纹的正确性和稳定性。
使用方法
python test.py
3. 项目配置文件介绍
environment.yml
environment.yml 是Conda环境配置文件，用于创建项目的运行环境。通过该文件，可以快速配置项目所需的依赖包和环境变量。
使用方法
conda env create -f environment.yml
conda activate map4
setup.py
setup.py 是项目的安装脚本，用于通过pip安装项目。它定义了项目的元数据和依赖关系，确保项目能够正确安装和运行。
使用方法
pip install .
README.md
README.md 是项目的说明文件，包含项目的概述、安装和使用说明。它是用户了解项目的第一手资料，建议在开始使用项目前仔细阅读。
内容概述
- 项目简介
- 安装指南
- 使用说明
- 常见问题解答
通过以上模块的介绍，您可以快速了解并开始使用MAP4项目。
map4 The MinHashed Atom Pair fingerprint of radius 2 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ma/map4