GenSLM 项目使用教程

GenSLM 项目使用教程

genslm GenSLMs: Genome-scale language models reveal SARS-CoV-2 evolutionary dynamics genslm 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ge/genslm

1. 项目目录结构及介绍

GenSLM 项目的目录结构如下:

genslm/
├── docs/
├── examples/
├── genslm/
│   ├── __init__.py
│   ├── model.py
│   ├── dataset.py
│   └── ...
├── requirements/
├── tests/
├── .gitattributes
├── .gitignore
├── CODE_OF_CONDUCT.md
├── CONTRIBUTING.md
├── LICENSE.md
├── MANIFEST.in
├── Makefile
├── README.md
├── setup.cfg
└── setup.py

目录结构介绍

  • docs/: 存放项目的文档文件。
  • examples/: 存放项目的示例代码。
  • genslm/: 项目的主要代码目录,包含模型、数据集等相关代码。
    • init.py: 初始化文件,使 genslm 成为一个 Python 包。
    • model.py: 定义了 GenSLM 模型的核心代码。
    • dataset.py: 定义了数据集的处理代码。
  • requirements/: 存放项目的依赖文件。
  • tests/: 存放项目的测试代码。
  • .gitattributes: Git 属性配置文件。
  • .gitignore: Git 忽略文件配置。
  • CODE_OF_CONDUCT.md: 项目的行为准则。
  • CONTRIBUTING.md: 贡献指南。
  • LICENSE.md: 项目的许可证文件。
  • MANIFEST.in: 打包配置文件。
  • Makefile: 项目的 Makefile 文件,用于自动化构建。
  • README.md: 项目的介绍文档。
  • setup.cfg: 项目的配置文件。
  • setup.py: 项目的安装脚本。

2. 项目的启动文件介绍

GenSLM 项目的启动文件主要是 setup.pyMakefile

setup.py

setup.py 是 Python 项目的标准安装脚本,用于定义项目的元数据和依赖项。通过运行 python setup.py install,可以将项目安装到本地环境中。

Makefile

Makefile 是一个自动化构建工具,用于简化项目的编译、测试和部署过程。通过运行 make 命令,可以执行 Makefile 中定义的任务。

3. 项目的配置文件介绍

GenSLM 项目的主要配置文件是 setup.cfgconfig.yaml

setup.cfg

setup.cfg 是 Python 项目的配置文件,用于定义项目的各种配置选项,如包的元数据、测试配置等。

config.yaml

config.yaml 是项目的运行时配置文件,用于定义模型的参数、数据路径等。在使用项目时,可以通过修改 config.yaml 文件来调整模型的行为。

总结

通过本教程,您应该对 GenSLM 项目的目录结构、启动文件和配置文件有了基本的了解。接下来,您可以根据项目的官方文档和示例代码,进一步探索和使用 GenSLM 项目。

genslm GenSLMs: Genome-scale language models reveal SARS-CoV-2 evolutionary dynamics genslm 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ge/genslm

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转载自blog.csdn.net/gitblog_00361/article/details/142842412